Une nouvelle vague de Covid-19 frappe la France au début de l’automne, bien que les niveaux du virus soient nettement inférieurs à ceux observés à la même période l’année précédente.
L’analyse des eaux usées dans 54 stations à travers la France a enregistré une augmentation de la présence du virus depuis le dernier rapport, a annoncé Santé publique France dans son dernier bulletin.
Cependant, le nombre de cas de Covid-19 signalés par les médecins généralistes n’a augmenté que faiblement.
Cela intervient alors que les autorités sanitaires ont confirmé que la campagne de vaccination contre la Covid-19 et la grippe pour l’hiver 2026/2027 débutera le 13 octobre, les règles de couverture restant inchangées par rapport aux années précédentes.
Présence accrue de la Covid-19 en France, au Royaume‑Uni et aux États‑Unis
L’analyse des eaux usées est désormais le principal moyen pour les autorités sanitaires françaises d’évaluer la présence du virus, maintenant qu’il est moins grave, beaucoup étant infectés sans le savoir et ne consultant pas pour se faire soigner.
Cela se produit alors que la maladie s’est muée en une affection persistante et permanente tout au long de l’année, semblable au rhume, bien qu’elle soit plus dangereuse pour les personnes souffrant de conditions de santé préexistantes ou de vulnérabilités.
L’analyse des eaux usées indique une circulation accrue du virus à l’échelle nationale en France par rapport à l’été.
Cela est cohérent avec les années post-pandémiques précédentes. Bien qu’il s’agisse d’une maladie présente toute l’année, des pics de Covid-19 à certains moments, généralement à l’automne, en hiver et au début du printemps, sont attendus.
Cependant, les mesures affichées restent nettement inférieures à celles de l’année dernière.
Les relevés indiquent une présence de 869,9 (rapport entre la concentration virale et l’azote ammoniacal dans l’eau) pour la semaine 36 de 2026, contre 2076,99 pour la même semaine en 2025.
Un pic de 3299,74 à la semaine 39 de 2025 semble extrêmement peu probable d’être dépassé, compte tenu des niveaux actuels plus bas du virus. Vous pouvez voir un graphique comparatif complet ici.
Les données transmises par les médecins généralistes via le programme des sentinelles indiquent une très faible augmentation des cas cliniques confirmés par rapport aux semaines précédentes, mais l’activité reste inférieure à celle des années précédentes.
Dans ces relevés, la Covid-19 et la grippe sont regroupées dans une même catégorie avec les autres maladies respiratoires aiguës (Infection respiratoire aiguë), ce qui donne collectivement 102 cas pour 100 000 habitants en France.
Il convient toutefois de noter que Santé publique France a signalé une augmentation du nombre d admissions aux urgences pour Covid-19 au cours des dernières semaines.
En comparaison, les derniers rapports du gouvernement britannique (portant sur les données jusqu’au 6 septembre, semaine 36 de l’année) indiquaient une légère augmentation des infections à Covid-19 selon la surveillance en laboratoire, mais une diminution des tests positifs issus des prélèvements des médecins généralistes en Angleterre.
Les admissions hospitalières sont restées stables, et les trois relevés étaient à des niveaux « baseline » (bas et attendus).
Aux États‑Unis, les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ont signalé une situation mitigée.
« Au 16 septembre 2026, nous estimons que les infections à Covid-19 augmentent ou sont susceptibles d’augmenter dans 27 États, diminuent ou sont susceptibles de diminuer dans 13 États, et ne changent pas dans 10 États », a-t-il déclaré.
Il demeure incertain quel sera l’impact de la variante actuelle du virus.
L’année dernière, les inquiétudes concernant les puissantes variantes « Frankenstein » se propageant à travers l’Europe ont amené les professionnels de santé à redouter une saison d’hospitalisations. Cependant, il n’y a pas eu de pic de décès par rapport à l’hiver 2024/2025.
Un rapport antérieur des autorités sanitaires sur les niveaux de Covid-19 au début de septembre 2026 avait avancé que l’augmentation des cas cet automne pourrait être due au retour de voyageurs en provenance d’Amérique du Nord.
L’analyse des eaux usées sur le continent a révélé une augmentation similaire de la présence du Covid-19 à la fin de l’été, mais jusqu’à présent cela ne s’est pas accompagné d’une flambée équivalente des hospitalisations.
Saison de vaccination contre la Covid et la grippe
Le gouvernement a annoncé que les campagnes de vaccination contre la grippe et la Covid-19 seront à nouveau combinées pour la prochaine saison, permettant aux personnes de recevoir les deux vaccinations en même temps (une dans chaque bras) si elles le souhaitent.
Il y a des changements mineurs dans le programme cette année, car davantage de professionnels de santé — y compris les infirmières — pourront à la fois prescrire et administrer les vaccinations.
Autre changement : les patients de 65 ans et plus seront encouragés à recevoir l’un des deux vaccins antigrippe spécifiques : l’Efluelda (un vaccin à dosage élevé) ou le Fluad (contenant un adjuvant).
Cependant, ils peuvent toujours opter pour la dose standard s’ils le souhaitent, mais le vaccin par défaut proposé sera probablement l’un des deux mentionnés ci-dessus.
En dehors de cela, il n’y a pas d’autres changements dans le processus de vaccination ni dans la couverture.
Des « bons » physiques pour la grippe seront envoyés par courrier aux personnes affiliées à l’assurance maladie, possédant une carte Vitale, et relevant de l’une des catégories suivantes :
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Personnes de 65 ans et plus
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Personnes de moins de 65 ans, y compris des enfants âgés de six mois et plus, souffrant de certaines maladies chroniques (plus d’informations disponibles ici)
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Femmes enceintes
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Personnes souffrant d’obésité, avec un indice de masse corporelle (IMC) supérieur ou égal à 40
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Personnes résidant dans un établissement de soins post-aigus ou dans un établissement médico-social résidentiel, quel que soit l’âge
De plus, des bons sont disponibles pour ceux qui ne sont pas vulnérables eux-mêmes mais qui travaillent avec des personnes vulnérables et des animaux, notamment :
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Professionnels de santé et tout professionnel en contact régulier et prolongé avec des personnes à risque
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Ceux qui sont proches d’enfants de moins de six mois à risque de complications graves liées à la grippe et ceux qui sont en contact avec des personnes immunodéprimées
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Aides à domicile pour les personnes des groupes vulnérables ci-dessus
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Professionnels exposés aux virus de la grippe porcine et aviaire, pour prévenir la transmission des virus grippaux humains aux animaux
Les personnes appartenant à l’un de ces groupes qui ne reçoivent pas de bon — ce qui est souvent le cas pour les femmes enceintes, les personnes présentant une obésité clinique, etc., lorsque les dossiers ne sont pas tenus — peuvent consulter un professionnel de santé pour se renseigner sur la possibilité d’en recevoir un, en apportant une preuve de leur condition.
Les moins de 11 ans ne recevront pas de bon mais devront obtenir une ordonnance d’un professionnel de santé.
Vous devez prendre le rendez-vous vous-même — chez un médecin généraliste, un pharmacien, ou avec un autre professionnel de santé autorisé à administrer le vaccin — en apportant votre bon et votre carte Vitale.
Si vous n’appartenez à aucun des groupes bénéficiant d’un bon gratuit, vous pouvez acheter vous-même un vaccin chez un pharmacien puis prendre rendez-vous avec lui (ou avec un autre professionnel de santé) pour recevoir l’injection.
Les prix peuvent varier selon le type de vaccin mais tournent autour de 6 à 10 €.
Vous devez aussi payer le coût du rendez-vous de vaccination, lors duquel l’injection est administrée.
Les vaccins pour les enfants de 2 à 17 ans ne relevant pas des groupes ci-dessus bénéficient d’une couverture de 65% du coût du vaccin; toutefois pour les autres groupes, le paiement est intégral, même si leur mutuelle peut couvrir une partie des coûts.
Le vaccin Covid-19 reste gratuit pour toutes les personnes affiliées à l’Assurance Maladie, à la fois pour le vaccin lui-même et pour le rendez-vous d’administration.
Cependant, le remboursement du rendez-vous de vaccination suit les règles habituelles (une couverture de 60% à 70% selon l’intervenant qui administre le vaccin, le reste étant généralement pris en charge par votre mutuelle).
Cela reste facultatif, mais fortement recommandé pour les personnes qui sont :
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Âgées de 65 ans et plus
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Vivant avec une comorbidité (y compris une hypertension compliquée, des conditions cardiaques, vasculaires, hépatiques, rénales et pulmonaires chroniques, diabète, obésité, cancer, ou personnes ayant reçu une greffe). Les personnes atteintes de trisomie 21 et de démence ont été ajoutées à cette liste l’année dernière
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Immunodéprimées
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Grosses
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Résidents d’un établissement de soins pour personnes âgées ou d’un établissement médico-social
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Vivant dans l’entourage immédiat ou en contact régulier avec des personnes immunodéprimées ou vulnérables
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Professionnels des secteurs de la santé et du soin social
Vous pouvez recevoir le vaccin à condition de n’avoir pas été infecté par le Covid-19 au cours des six derniers mois (trois mois si vous appartenez à l’un des groupes vulnérables listés ci-dessus).
